Kort svar: Generativ AI akselererer hovedsakelig tidlig legemiddelutvikling ved å generere kandidatmolekyler eller proteinsekvenser, foreslå synteseruter og fremheve testbare hypoteser, slik at team kan kjøre færre "blinde" eksperimenter. Den fungerer best når du håndhever harde begrensninger og validerer resultater; behandlet som et orakel, kan den villede med selvtillit.
Viktige konklusjoner:
Akselerasjon : Bruk GenAI til å utvide idégenereringen, og avgrens deretter med grundig filtrering.
Begrensninger : Krev egenskapsområder, stillasregler og nyhetsgrenser før generering.
Validering : Behandle utdata som hypoteser; bekreft med analyser og ortogonale modeller.
Sporbarhet : Loggfør forespørsler, utdata og begrunnelse, slik at beslutninger forblir reviderbare og gjennomgåbare.
Motstand mot misbruk : Forhindre lekkasje og overdreven selvtillit med styring, tilgangskontroller og menneskelig gjennomgang.

Artikler du kanskje vil lese etter denne:
🔗 AIs rolle i helsevesenet
Hvordan AI forbedrer diagnose, arbeidsflyter, pasientbehandling og resultater.
🔗 Vil AI erstatte radiologer?
Utforsker hvordan automatisering forbedrer radiologi og hva som forblir menneskelig.
🔗 Vil AI erstatte leger?
Ærlig blikk på AIs innvirkning på legers jobber og praksis.
🔗 De beste AI-laboratorieverktøyene for vitenskapelig oppdagelse
Topp AI-laboratorieverktøy for å akselerere eksperimenter, analyser og oppdagelser.
Rollen til generativ AI i legemiddeloppdagelse, i ett åndedrag 😮💨
Generativ AI hjelper legemiddelteam med å lage kandidatmolekyler, forutsi egenskaper, foreslå modifikasjoner, foreslå synteseruter, utforske biologiske hypoteser og komprimere iterasjonssykluser – spesielt innen tidlig oppdagelse og optimalisering av potensielle kunder. Nature 2023 (gjennomgang av ligandoppdagelse) Elsevier 2024-gjennomgang (generative modeller i de novo legemiddeldesign)
Og ja, den kan også generere tull med selvtillit. Det er en del av avtalen. Som en veldig entusiastisk praktikant med en rakettmotor. Klinikernes veiledning (hallusinasjonsrisiko) npj Digital Medicine 2025 (hallusinasjons- + sikkerhetsrammeverk)
Hvorfor dette er viktigere enn folk innrømmer 💥
Mye oppdagelsesarbeid er «søk». Søk i kjemisk rom, søk i biologi, søk i litteratur, søk i struktur-funksjon-forhold. Problemet er at kjemisk rom er ... i utgangspunktet uendelig. Accounts of Chemical Research 2015 (kjemisk rom) Irwin & Shoichet 2009 (kjemisk romskala)
Du kan bruke flere liv på bare å prøve «rimelige» variasjoner.
Generativ AI endrer arbeidsflyten fra:
-
«La oss teste hva vi kan komme på»
til:
-
«La oss generere et større, smartere sett med alternativer, og deretter teste de beste»
Det handler ikke om å eliminere eksperimenter. Det handler om å velge bedre eksperimenter . 🧠 Nature 2023 (gjennomgang av ligandfunn)
I tillegg, og dette er lite diskutert, hjelper det team med å snakke på tvers av fagområder . Kjemikere, biologer, DMPK-folk, beregningsforskere ... alle har forskjellige mentale modeller. Et anstendig generativt system kan fungere som en delt skisseblokk. Frontiers in Drug Discovery 2024-gjennomgang
Hva gjør en god versjon av generativ AI for legemiddelutvikling? ✅
Ikke all generativ AI er skapt like. En «god» versjon for dette området handler mindre om prangende demonstrasjoner og mer om usexy pålitelighet (usexy er en dyd her). Nature 2023 (anmeldelse av ligandoppdagelse)
Et godt generativt AI-oppsett har vanligvis:
-
Domeneforankring : trent eller tilpasset kjemiske, biologiske og farmakologiske data (ikke bare generisk tekst) 🧬 Elsevier 2024-gjennomgang (generative modeller)
-
Begrensninger – første generasjon : den kan overholde regler som lipofilisitetsområder, stillasbegrensninger, bindingsstedsegenskaper, selektivitetsmål. JCIM 2024 (diffusjonsmodeller i de novo legemiddeldesign). REINVENT 4 (åpent rammeverk).
-
Egenskapsbevissthet : den genererer molekyler som ikke bare er nye, men også «ikke latterlige» i ADMET-termer ADMETlab 2.0 (hvorfor tidlig ADMET er viktig)
-
Usikkerhetsrapportering : den signaliserer når det er gjetting kontra når det er solid (selv et grovt konfidensbånd hjelper) OECD QSAR-valideringsprinsipper (anvendelsesdomene)
-
Menneskelig kontroll i sløyfen : kjemikere kan styre, avvise og veilede resultater raskt Nature 2023 (arbeidsflyt + kontekst for oppdagelsesteknologi)
-
Sporbarhet : du kan se hvorfor et forslag oppsto (i det minste delvis), eller du følger OECD QSAR-veiledningen i blinde (modelltransparens + validering)
-
Evalueringssele : docking, QSAR, filtre, retrosyntesekontroller - alt koblet inn 🔧 Nature 2023 (ligandoppdagelsesgjennomgang) Maskinlæring i CASP (Coley 2018)
-
Skjevhets- og lekkasjekontroller : for å unngå at memorering av treningsdata sniker seg inn (jepp, det skjer) USENIX 2021 (utvinning av treningsdata) Vogt 2023 (bekymringer om nyhet/unikhet)
Hvis den generative AI-en din ikke takler begrensninger, er den i bunn og grunn en nyhetsgenerator. Moro på fester. Mindre moro i et narkotikaprogram.
Der generativ AI passer inn i hele legemiddelutviklingsprosessen 🧭
Her er det enkle mentale kartet. Generativ AI kan bidra til nesten alle stadier, men den fungerer best der iterasjon er dyrt og hypoteserommet er enormt. Nature 2023 (gjennomgang av ligandoppdagelse)
Vanlige kontaktpunkter:
-
Måloppdagelse og validering (hypoteser, kartlegging av sykdomsveier, forslag til biomarkører) Gjennomgang av Frontiers in Drug Discovery 2024
-
Treffidentifikasjon (virtuell screeningforsterkning, de novo treffgenerering) Nature Biotechnology 2019 (GENTRL)
-
Optimalisering av potensielle kunder (forslag til analoger, flerparameterjustering) REINVENT 4
-
Preklinisk støtte (ADMET-egenskapsprediksjon, noen ganger formuleringstips) ADMETlab 2.0
-
CMC og synteseplanlegging (forslag til retrosyntese, rutesortering) AiZynthFinder 2020 Coley 2017 (datamaskinassistert retrosyntese)
-
Kunnskapsarbeid (litteratursyntese, konkurransedyktige landskapssammendrag) 📚 Mønstre 2025 (LLM-er i legemiddelutvikling)
I mange programmer kommer de største gevinstene fra arbeidsflytintegrasjon , ikke fra at én enkelt modell er «genial». Modellen er motoren – rørledningen er bilen. Nature 2023 (gjennomgang av ligandoppdagelse)
Sammenligningstabell: populære generative AI-tilnærminger brukt i legemiddelutvikling 📊
En litt uperfekt tabell, fordi det virkelige liv er litt uperfekt.
| Verktøy / Tilnærming | Best for (publikum) | Pris-aktig | Hvorfor det fungerer (og når det ikke fungerer) |
|---|---|---|---|
| De novo molekylgeneratorer (SMILES, grafer) | Medisinsk kjemi + komp. kjemi | $$-$$$ | Flink til å utforske nye analoger raskt 😎 - men kan spytte ut ustabile mistilpassede REINVENT 4 GENTRL (Nature Biotech 2019) |
| Protein-/strukturgeneratorer | Biologiske team, strukturbiologi | $$$ | Hjelper med å foreslå sekvenser + strukturer - men «ser plausibel ut» er ikke det samme som «fungerer» AlphaFold (Nature 2021) RFdiffusion (Nature 2023) |
| Diffusjonsstil molekylær design | Avanserte ML-team | $$-$$$$ | Sterk på betinging og mangfold – oppsett kan være… en hel greie JCIM 2024 (diffusjonsmodeller) PMC 2025 diffusjonsgjennomgang |
| Eiendomsprediksjonskopiloter (QSAR + GenAI-kombinasjon) | DMPK, prosjektteam | $$ | Bra for triage og rangering - dårlig hvis det behandles som evangeliet 😬 OECD (anvendelsesdomene) ADMETlab 2.0 |
| Retrosynteseplanleggere | Prosesskjemi, CMC | $$-$$$ | Fremskynder ruteideutvikling – trenger fortsatt mennesker for gjennomførbarhet og sikkerhet AiZynthFinder 2020 Coley 2018 (CASP) |
| Multimodale laboratorie-copiloter (tekst + analysedata) | Oversettelsesteam | $$$ | Nyttig for å trekke signaler på tvers av datasett - utsatt for overdreven selvtillit hvis dataene er ujevne Nature 2024 (batcheffekter i celleavbildning) npj Digital Medicine 2025 (multimodal i bioteknologi) |
| Litteratur- og hypoteseassistenter | Alle, i praksis | $ | Reduserer lesetiden mye – men hallusinasjoner kan være vanskelige å håndtere, som sokker som forsvinner. Mønstre 2025 (LLM-er i legemiddelutvikling) Klinikerveiledning (hallusinasjoner) |
| Tilpassede fundamentmodeller | Store farmasøytiske, velfinansierte bioteknologiselskaper | $$$$ | Beste kontroll + integrasjon – også dyrt og tregt å bygge (beklager, det er sant) Anmeldelse av Frontiers in Drug Discovery 2024 |
Merknader: Prisene varierer mye avhengig av skala, beregningsevne, lisensiering og om teamet ditt ønsker «plug and play» eller «la oss bygge et romskip»
Nærmere titt: Generativ AI for treffoppdagelse og de novo-design 🧩
Dette er hovedbrukstilfellet: generer kandidatmolekyler fra bunnen av (eller fra et stillas) som samsvarer med en målprofil. Nature Biotechnology 2019 (GENTRL) REINVENT 4
Slik fungerer det vanligvis i praksis:
-
Definer begrensninger
-
målklasse, bindingslommeform, kjente ligander
-
egenskapsområder (løselighet, logP, PSA, osv.) Lipinski (5-regelkontekst)
-
nyhetsbegrensninger (unngå kjente IP-soner) 🧠 Vogt 2023 (nyhetsevaluering)
-
-
Generer kandidater
-
stillashopping
-
fragmentvekst
-
Forslag til «dekorer denne kjernen»
-
flermålsgenerering (bind + permeabel + giftfri-aktig) REINVENT 4 Elsevier 2024-gjennomgang (generative modeller)
-
-
Filtrer aggressivt
-
regler for medisinsk kjemi
-
PAINS og reaktive gruppefiltre Baell & Holloway 2010 (PAINS)
-
syntetiseringskontroller AiZynthFinder 2020
-
docking / scoring (uperfekt men nyttig) Nature 2023 (gjennomgang av ligandfunn)
-
-
Velg et lite sett for syntese
-
Mennesker plukker fortsatt, fordi mennesker kan lukte tull noen ganger
-
Den pinlige sannheten: verdien er ikke bare «nye molekyler». Det er nye molekyler som gir mening for programmets begrensninger . Den siste delen er alt. Nature 2023 (gjennomgang av ligandoppdagelse)
Og en liten overdrivelse innkommende: Når det gjøres bra, kan det føles som om du har ansatt et team av utrettelige juniorkjemikere som aldri sover og aldri klager. Men igjen, de forstår heller ikke hvorfor en spesifikk beskyttelsesstrategi er et mareritt, så ... balanse 😅.
Nærmere titt: Optimalisering av potensielle kunder med generativ AI (multiparameterjustering) 🎛️
Det er innen leadoptimalisering som drømmer blir kompliserte.
Du vil:
-
potens opp
-
selektivitet opp
-
metabolsk stabilitet opp
-
løselighet opp
-
sikkerhetssignaler ned
-
permeabilitet «akkurat passe»
-
OG fortsatt være syntetiserbar
Dette er klassisk flermålsoptimalisering. Generativ AI er uvanlig god til å foreslå et sett med avveiningsløsninger i stedet for å late som om det finnes én perfekt forbindelse. REINVENT 4 Elsevier 2024-gjennomgang (generative modeller)
Praktiske måter team bruker det på:
-
Analogt forslag : «Lag 30 varianter som reduserer clearance, men beholder potensen»
-
Substituentskanning : guidet utforskning i stedet for brute-force-opplisting
-
Stillashopping : når en kjerne treffer en vegg (tox, IP eller stabilitet)
-
Forklaringsmessige forslag : «Denne polargruppen kan hjelpe løseligheten, men kan skade permeabiliteten» (ikke alltid riktig, men nyttig)
En advarsel: egenskapsprediktorer kan være skjøre. Hvis treningsdataene dine ikke samsvarer med den kjemiske serien din, kan modellen være helt feil. Altså, veldig feil. Og den vil ikke rødme. OECD QSAR-valideringsprinsipper (anvendelsesdomene) Weaver 2008 (QSAR-anvendelsesdomene)
Nærmere titt: ADMET, toksisitet og screening av «vær så snill, ikke drep programmet» 🧯
Det er på ADMET at mange kandidater i stillhet feiler. Generativ AI løser ikke biologiproblemer, men den kan redusere feil som kan unngås. ADMETlab 2.0 Waring 2015 (frafall)
Vanlige roller:
-
forutsi metabolske forpliktelser (metabolismesteder, clearance-trender)
-
flagging av sannsynlige toksisitetsmotiver (varsler, reaktive mellomprodukter)
-
estimering av løselighets- og permeabilitetsområder
-
foreslå modifikasjoner for å redusere hERG-risiko eller forbedre stabiliteten 🧪 FDA (ICH E14/S7B spørsmål og svar) EMA (ICH E14/S7B oversikt)
Det mest effektive mønsteret pleier å se slik ut: bruk GenAI til å foreslå alternativer, men bruk spesialiserte modeller og eksperimenter for å verifisere.
Generativ AI er idégenereringsmotoren. Validering eksisterer fortsatt i analyser.
Nærmere titt: Generativ AI for biologiske legemidler og proteinteknikk 🧬✨
Legemiddelutvikling handler ikke bare om små molekyler. Generativ kunstig intelligens brukes også til:
-
generering av antistoffsekvens
-
forslag til modning av affinitet
-
forbedringer av proteinstabilitet
-
enzymteknikk
-
Utforskning av peptidterapeutiske midler ProteinMPNN (Vitenskap 2022) Rives 2021 (proteinspråkmodeller)
Protein- og sekvensgenerering kan være kraftig fordi «språket» i sekvenser kartlegges overraskende godt til ML-metoder. Men her er et tilfeldig tilbakespor: det kartlegges godt ... helt til det ikke gjør det. Fordi immunogenisitet, uttrykk, glykosyleringsmønstre og utviklingsbarhetsbegrensninger kan være brutale. AlphaFold (Nature 2021) ProteinGenerator (Nat Biotech 2024)
Så de beste oppsettene inkluderer:
-
utviklingsfiltre
-
risikoscoring for immunogenisitet
-
begrensninger i produksjonsevne
-
våte labløkker for rask iterasjon 🧫
Hvis du hopper over dem, får du en nydelig sekvens som oppfører seg som en diva i produksjon.
Nærmere titt: Synteseplanlegging og forslag til retrosyntese 🧰
Generativ AI sniker seg også inn i kjemiske operasjoner, ikke bare molekylidéutvikling.
Retrosynteseplanleggere kan:
-
foreslå ruter til en målforbindelse
-
foreslå kommersielt tilgjengelige utgangsmaterialer
-
ranger ruter etter antall skritt eller oppfattet gjennomførbarhet
-
hjelpe kjemikere med å raskt utelukke «søte, men umulige» ideer AiZynthFinder 2020 Coley 2018 (CASP)
Dette kan spare deg for sanntid, spesielt når du utforsker mange mulige strukturer. Likevel er mennesker viktige her fordi:
-
endringer i reagenstilgjengelighet
-
sikkerhets- og skalabekymringer er reelle
-
Noen trinn ser fine ut på papiret, men mislykkes gjentatte ganger
En litt knapt perfekt metafor, men jeg bruker den likevel: retrosyntese-AI er som en GPS som stort sett har rett, bortsett fra at den noen ganger leder deg gjennom en innsjø og insisterer på at det er en snarvei. 🚗🌊 Coley 2017 (datamaskinassistert retrosyntese)
Data, multimodale modeller og den ujevne virkeligheten i laboratorier 🧾🧪
Generativ AI elsker data. Laboratorier produserer data. På papiret høres det enkelt ut.
Ha. Nei.
Ekte laboratoriedata er:
-
ufullstendig
-
støyende
-
full av batch-effekter Leek et al. 2010 (batch-effekter) Nature 2024 (batch-effekter i celleavbildning)
-
spredt på tvers av formater
-
velsignet med «kreative» navnekonvensjoner
Multimodale generative systemer kan kombinere:
-
analyseresultater
-
kjemiske strukturer
-
bilder (mikroskopi, histologi)
-
omikk (transkriptomikk, proteomikk)
-
tekst (protokoller, ELN-er, rapporter) npj Digital medisin 2025 (multimodal innen bioteknologi) Medisinsk bildeanalyse 2025 (multimodal AI innen medisin)
Når det fungerer, er det fantastisk. Du kan avdekke ikke-åpenbare mønstre og foreslå eksperimenter som en enkelt spesialist kanskje ville overse.
Når det mislykkes, mislykkes det stille. Det smeller ikke igjen døren. Det bare dytter deg mot en sikker, feil konklusjon. Derfor er styring, validering og domenegjennomgang ikke valgfrie. Klinikerveiledning (hallusinasjoner) npj Digital Medicine 2025 (hallusinasjons- + sikkerhetsrammeverk)
Risikoer, begrensninger og delen «ikke la deg lure av flytende utdata» ⚠️
Hvis du bare husker én ting, husk dette: generativ AI er overbevisende. Det kan høres riktig ut samtidig som det er feil. Klinikerveiledning (hallusinasjoner)
Viktige risikoer:
-
Hallusinerte mekanismer : plausibel biologi som ikke er ekte. Klinikerveiledning (hallusinasjoner).
-
Datalekkasje : generering av noe som er for likt kjente forbindelser USENIX 2021 (utvinning av treningsdata) Vogt 2023 (bekymringer om nyhet/unikhet)
-
Overoptimalisering : jakt på predikerte poengsummer som ikke oversettes in vitro Nature 2023 (ligandoppdagelsesgjennomgang)
-
Skjevhet : treningsdata skjevt mot visse kjemotyper eller mål Vogt 2023 (modellvurdering + skjevhet/nyhet)
-
Falsk nyhet : «nye» molekyler som egentlig er trivielle varianter Vogt 2023
-
Forklaringsmangler : vanskelig å begrunne beslutninger overfor interessenter OECD QSAR-valideringsprinsipper
-
Sikkerhets- og IP-bekymringer : sensitive programdetaljer i ledetekster 😬 USENIX 2021 (utvinning av opplæringsdata)
Tiltak som hjelper i praksis:
-
holde mennesker i beslutningssløyfen
-
loggforespørsler og utdata for sporbarhet
-
validere med ortogonale metoder (analyser, alternative modeller)
-
håndheve begrensninger og filtre automatisk
-
Behandle resultater som hypoteser, ikke sannhetstabletter OECD QSAR-veiledning
Generativ AI er et kraftverktøy. Kraftverktøy gjør deg ikke til snekker ... de gjør bare feil raskere hvis du ikke vet hva du gjør.
Hvordan team tar i bruk generativ AI uten kaos 🧩🛠️
Team ønsker ofte å bruke dette uten å gjøre organisasjonen om til en vitenskapsmesse. En praktisk implementeringsvei ser slik ut:
-
Start med én flaskehals (treffutvidelse, analoggenerering, litteraturvurdering) Nature 2023 (ligandoppdagelsesgjennomgang)
-
Bygg en tett evalueringsløyfe (filtre + docking + egenskapssjekker + kjemisk gjennomgang) REINVENT 4 AiZynthFinder 2020
-
Mål resultater (tidsbesparelse, treffprosent, reduksjon av frafall) Waring 2015 (frafall)
-
Integrer med eksisterende verktøy (ELN, stoffregister, analysedatabaser) Edinburgh ELN-ressurs
-
Opprett bruksregler (hva som kan bli spurt om, hva som forblir offline, gjennomgangstrinn) USENIX 2021 (risiko for datauttrekking)
-
Tren folk forsiktig (seriøst, de fleste feil kommer fra feilbruk, ikke modellen) Klinikerveiledning (hallusinasjoner)
Undervurder heller ikke kultur. Hvis kjemikere føler at AI blir dyttet på dem, vil de ignorere det. Hvis det sparer dem tid og respekterer ekspertisen deres, vil de ta det i bruk raskt. Mennesker er morsomme sånn 🙂.
Hva er rollen til generativ AI i legemiddeloppdagelse når man zoomer ut? 🔭
Zoomet ut, rollen er ikke å «erstatte forskere». Det er å «utvide vitenskapelig båndbredde». Nature 2023 (gjennomgang av ligandfunn)
Det hjelper team:
-
utforske flere hypoteser per uke
-
foreslå flere kandidatstrukturer per syklus
-
prioritere eksperimenter mer intelligent
-
komprimere iterasjonsløkker mellom design og test
-
dele kunnskap på tvers av siloer Mønstre 2025 (LLM-er i legemiddelutvikling)
Og kanskje den mest undervurderte delen: det hjelper deg å ikke kaste bort den dyre menneskelige kreativiteten på repeterende oppgaver. Folk burde tenke på mekanismer, strategier og tolkninger – ikke bruke dager på å generere variantlister for hånd. Nature 2023 (gjennomgang av ligandoppdagelse)
Så ja, rollen til generativ AI i legemiddelforskning er en akselerator, en generator, et filter og noen ganger en bråkmaker. Men en verdifull en.
Avsluttende oppsummering 🧾✅
Generativ AI er i ferd med å bli en kjernekompetanse innen moderne legemiddelutvikling fordi den kan generere molekyler, hypoteser, sekvenser og ruter raskere enn mennesker – og den kan hjelpe team med å velge bedre eksperimenter. Frontiers in Drug Discovery 2024-gjennomgang Nature 2023 (ligandoppdagelsesgjennomgang)
Sammendragspunkter:
-
Det er best ved tidlig oppdagelse og potensielle kunders optimaliseringsløkker ⚙️ REINVENT 4
-
Den støtter små molekyler og biologiske legemidler GENTRL (Nature Biotech 2019) ProteinMPNN (Science 2022)
-
Det øker produktiviteten ved å utvide idétrakten Nature 2023 (ligandoppdagelsesgjennomgang)
-
Det trenger begrensninger, validering og mennesker for å unngå selvsikkert tullprat. OECD QSAR-prinsipper. Klinikerveiledning (hallusinasjoner).
-
De største gevinstene kommer fra arbeidsflytintegrasjon , ikke markedsføringsskum Nature 2023 (ligandoppdagelsesgjennomgang)
Hvis du behandler det som en samarbeidspartner – ikke et orakel – kan det virkelig føre programmer fremover. Og hvis du behandler det som et orakel … vel, da kan du ende opp med å følge den GPS-en ut i sjøen igjen. 🚗🌊
Vanlige spørsmål
Hva er rollen til generativ kunstig intelligens i legemiddelutvikling?
Generativ AI utvider primært idétrakten i tidlig oppdagelse og potensiell kundeemneoptimalisering ved å foreslå kandidatmolekyler, proteinsekvenser, synteseruter og biologiske hypoteser. Verdien er mindre «erstatt eksperimenter» og mer «velg bedre eksperimenter» ved å generere mange alternativer og deretter filtrere grundig. Den fungerer best som en akselerator i en disiplinert arbeidsflyt, ikke som en frittstående beslutningstaker.
Hvor presterer generativ AI best i legemiddelutviklingsprosessen?
Det har en tendens til å levere mest verdi der hypoteseområdet er stort og iterasjon er dyrt, for eksempel treffidentifisering, de novo-design og leadoptimalisering. Team bruker det også til ADMET-triage, retrosynteseforslag og litteratur- eller hypotesestøtte. De største gevinstene kommer vanligvis fra å integrere generering med filtre, scoring og menneskelig gjennomgang i stedet for å forvente at én enkelt modell skal være «smart»
Hvordan setter man begrensninger slik at generative modeller ikke produserer ubrukelige molekyler?
En praktisk tilnærming er å definere begrensninger før generering: egenskapsområder (som løselighet eller logP-mål), regler for stillas eller understruktur, bindingsstedsfunksjoner og nyhetsgrenser. Deretter håndheve medisinske kjemiske filtre (inkludert PAINS/reaktive grupper) og syntetiserbarhetskontroller. Begrensningsgenerering er spesielt nyttig med diffusjonsbasert molekylær design og rammeverk som REINVENT 4, der flermålsmessige mål kan kodes.
Hvordan bør team validere GenAI-utdata for å unngå hallusinasjoner og overdreven selvtillit?
Behandle alle resultater som en hypotese, ikke en konklusjon, og valider med analyser og ortogonale modeller. Kombiner generering med aggressiv filtrering, docking eller scoring der det er passende, og kontroller av anvendelighetsdomenet for prediktorer i QSAR-stil. Gjør usikkerhet synlig når det er mulig, fordi modeller kan ta feil basert på kjemi utenfor distribusjon eller usikre biologiske påstander. Gjennomgang av data fra mennesker i løkken er fortsatt en sentral sikkerhetsfunksjon.
Hvordan kan du forhindre datalekkasje, IP-risiko og «memoriserte» utganger?
Bruk styring og tilgangskontroller slik at sensitive programdetaljer ikke plasseres tilfeldig i ledetekster, og loggfør ledetekster/utdata for revidering. Håndhev nyhets- og likhetskontroller slik at genererte kandidater ikke sitter for nær kjente forbindelser eller beskyttede regioner. Hold klare regler for hvilke data som er tillatt i eksterne systemer, og foretrekk kontrollerte miljøer for arbeid med høy sensitivitet. Menneskelig gjennomgang bidrar til å fange opp «for kjente» forslag tidlig.
Hvordan brukes generativ AI til optimalisering av potensielle kunder og flerparameterjustering?
I potensiell optimalisering er generativ AI verdifull fordi den kan foreslå flere avveiningsløsninger i stedet for å jage én enkelt «perfekt» forbindelse. Vanlige arbeidsflyter inkluderer analoge forslag, guidet substituentskanning og scaffoldhopping når potens-, toksikologiske eller IP-begrensninger blokkerer fremdriften. Egenskapsprediktorer kan være skjøre, så team rangerer vanligvis kandidater med flere modeller og bekrefter deretter de beste alternativene eksperimentelt.
Kan generativ AI også hjelpe med biologiske legemidler og proteinteknologi?
Ja – team bruker det til generering av antistoffsekvenser, ideer til affinitetsmodning, forbedringer av stabilitet og utforskning av enzymer eller peptider. Generering av proteiner/sekvenser kan se plausibel ut uten å være utviklingsbar, så det er viktig å bruke filtre for utviklingsbarhet, immunogenisitet og produserbarhet. Strukturelle verktøy som AlphaFold kan støtte resonnement, men «plausibel struktur» er fortsatt ikke bevis på uttrykk, funksjon eller sikkerhet. Våtlaboratorieløkker er fortsatt viktige.
Hvordan støtter generativ AI synteseplanlegging og retrosyntese?
Retrosynteseplanleggere kan foreslå ruter, startmaterialer og ruterangeringer for å fremskynde idéutvikling og raskt utelukke umulige veier. Verktøy og tilnærminger som AiZynthFinder-lignende planlegging er mest effektive når de kombineres med reelle gjennomførbarhetskontroller fra kjemikere. Tilgjengelighet, sikkerhet, oppskaleringsbegrensninger og «papirreaksjoner» som mislykkes i praksis krever fortsatt menneskelig dømmekraft. Brukt på denne måten sparer det tid uten å late som om kjemien er løst.
Referanser
-
Nature - Gjennomgang av ligandfunn (2023) - nature.com
-
Naturbioteknologi - GENTRL (2019) - nature.com
-
Natur - AlphaFold (2021) - nature.com
-
Natur - RFdiffusjon (2023) - nature.com
-
Naturbioteknologi - Proteingenerator (2024) - nature.com
-
Nature Communications - Batcheffekter i celleavbildning (2024) - nature.com
-
npj Digital Medisin - Hallusinasjon + sikkerhetsrammeverk (2025) - nature.com
-
npj Digital Medisin - Multimodal i bioteknologi (2025) - nature.com
-
Vitenskap - ProteinMPNN (2022) - science.org
-
Cellemønstre - LLM-er i legemiddelutvikling (2025) - cell.com
-
ScienceDirect (Elsevier) - Generative modeller i de novo legemiddeldesign (2024) - sciencedirect.com
-
ScienceDirect (Elsevier) - Vogt (2023): bekymringer rundt nyhet/unikhet - sciencedirect.com
-
Medisinsk bildeanalyse (ScienceDirect) - Multimodal AI i medisin (2025) - sciencedirect.com
-
PubMed Central - Klinikerveiledning (risiko for hallusinasjoner) - nih.gov
-
Beretninger om kjemisk forskning (ACS-publikasjoner) - Chemical space (2015) - acs.org
-
PubMed Central - Irwin & Shoichet (2009): kjemisk romskala - nih.gov
-
Frontiers in Drug Discovery (PubMed Central) - Anmeldelse (2024) - nih.gov
-
Journal of Chemical Information and Modeling (ACS Publications) - Diffusjonsmodeller i de novo legemiddeldesign (2024) - acs.org
-
PubMed Central - REINVENT 4 (åpent rammeverk) - nih.gov
-
PubMed Central - ADMETlab 2.0 (tidlig ADMET-sak) - nih.gov
-
OECD - Prinsipper for validering av (Q)SAR-modeller for regulatoriske formål - oecd.org
-
OECD - Veiledningsdokument om validering av (Q)SAR-modeller - oecd.org
-
Accounts of Chemical Research (ACS Publications) - Dataassistert synteseplanlegging / CASP (Coley, 2018) - acs.org
-
ACS Central Science (ACS Publications) - Datamaskinassistert retrosyntese (Coley, 2017) - acs.org
-
PubMed Central - AiZynthFinder (2020) - nih.gov
-
PubMed - Lipinski: Kontekst om 5-regelen - nih.gov
-
Journal of Medicinal Chemistry (ACS Publications) - Baell & Holloway (2010): SMERTER - acs.org
-
PubMed - Waring (2015): frafall - nih.gov
-
PubMed - Rives (2021): proteinspråkmodeller - nih.gov
-
PubMed Central - Leek et al. (2010): batcheffekter - nih.gov
-
PubMed Central - Diffusion-gjennomgang (2025) - nih.gov
-
FDA - E14 og S7B: klinisk og ikke-klinisk evaluering av QT/QTc-intervallforlengelse og proarytmisk potensial (spørsmål og svar) - fda.gov
-
Det europeiske legemiddelkontoret ( – oversikt over retningslinjen E14/S7B – europa.eu
-
USENIX - Carlini et al. (2021): utvinning av treningsdata fra språkmodeller - usenix.org
-
Universitetet i Edinburgh – Digitale forskningstjenester – Ressurs for elektronisk laboratorienotatbok (ELN) – ed.ac.uk
-
ScienceDirect (Elsevier) - Weaver (2008): QSAR-anvendelsesdomene - sciencedirect.com